Mélanie vit à Paris avec sa fille Blanche, six ans. Un matin d'hiver, l'enfant découvre un sac de graines de baobab oublié dans un placard et décide de les planter. Lorsque l'une d'elles germe, leur quotidien se dérègle peu à peu. Tandis que Blanche adopte l'arbre comme confident et se met en tête de le replanter sur sa terre d'origine, des voix et des souvenirs longtemps enfouis reviennent en mémoire à Mélanie. Son enfance en Afrique, sa nounou sénégalaise disparue, le maraboutage autour de la naissance de sa fille... À mesure que la pousse grandit, Mélanie est emportée dans une quête intime qui l'amène à revisiter son histoire et celle des pays où elle a grandi. Introspection morcelée, dialogue avec les fantômes, incursions dans la grande histoire, Baobab explore nos racines invisibles et les silences à l'oeuvre dans la construction de nos récits identitaires.